在太古时代，来自宇宙的神秘能源盖塔射线突然降临地球，导致地面上绝大多数恐龙灭绝，剩余的逃入地底进化为恐龙人类；早乙女研究所把这未知的能源视为人类新的希望加以开发。
但也因为如此，畏惧盖塔射线的恐龙帝国把早乙女研究所视为必除的眼中钉。为了保住盖塔射线也只有与恐龙帝国交战了。于是早乙女博士研发了以爬虫人类的弱点——盖塔射线作为动力源的超级机器人。但也因动力过于强大根本没人可以驾驶。
后来他发现了在全国空手道大会大闹一场的空手道家流龙马、企图引发革命来霸占学园的学生运动家神隼人，藉以对抗恐龙帝国；在经历几度的交战之后柔道家——巴武藏也志愿成为盖塔的第三位驾驶员，无止尽的防卫战就此揭开……